Фамилия Комендаров — одна из тех, где внешне прозрачная основа таит в себе сразу несколько возможных профессий, и выбор между ними зависит от того, в какой среде и когда фамилия закрепилась. Разберёмся по порядку.

Первое, что приходит на ум — слово «комендант». В русском языке оно известно с петровских времён и означало начальника крепости, гарнизона или военного городка. Однако в фамилиях на -ов редко отражаются столь высокие должности. Скорее, основа «комендар» — это искажённое диалектное произношение слова «комендант», где конечное «т» отпало (сравните: «солдат» — «солдатов», но «комендант» — «комендантов» — формально правильнее, а «комендар» — просторечное). По этой версии, Комендаров — потомок человека, который служил комендантом или был приписан к комендантской службе: вестовой, караульный, смотритель.

Вторая, не менее вероятная версия, связана с польским или украинским влиянием. В польском языке есть слово «komendarz» — так называли полицейского пристава или начальника стражи. На западных территориях Российской империи (Беларусь, Украина, Польша) фамилия могла возникнуть именно от этой формы. Суффикс -ар в польских фамилиях обычен, а при переходе в русскую среду его переоформили в типичный -ов, добавив патронимическое окончание.

Наконец, существует и бытовая версия: «комендар» — это человек, который командовал, распоряжался, «комендарил» (глагол, бытовавший в народной речи). В этом случае фамилия — не по должности, а по прозвищу: так могли назвать крикливого или властного мужика, который любил указывать, что и как делать, даже не имея на то официального чина.

Словообразовательно фамилия проста: основа Комендар- + суффикс -ов, обозначающий принадлежность («чей?» — сын Комендара). Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Комендаро́в, хотя в бытовой речи встречается и вариант с ударением на «а».

География фамилии указывает на юго-запад России, а также на регионы с историческим польским присутствием: Смоленщина, Брянщина, Белгородчина. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении — в каждом конкретном случае предок был либо военным служителем, либо польским урядником, либо просто «командиром» в своей деревне. Выбрать одну версию без знания семейной истории невозможно, но все три объединяет одно: носитель фамилии Комендаров — потомок человека, который в той или иной форме имел власть или распоряжался другими.