Фамилия Комышные (а также её вариант Комышный) происходит от географического названия — скорее всего, от местечка Комышна, которое находилось в Полтавской губернии, на возвышенности правого берега реки. Основатель рода, вероятно, был выходцем из этого села. Само название поселения восходит к украинскому слову «комиш» — то есть «камыш». Таким образом, фамилия прямо указывает на местность, заросшую камышом, или на человека, оттуда родом.

Модель образования здесь типичная для украинских и южнорусских фамилий: суффикс -н- (Комыш-н-ый) превращает название места в прилагательное, которое затем закрепилось как прозвище, а позже — как фамилия. Форма Комышные, с окончанием -ые, характерна для фамилий, которые бытуют во множественном числе: так часто называли целую семью или династию («Комышные приехали»). В письменных источниках XIX века такие фамилии встречаются в основном в среде казачества и крестьянства Левобережной Украины.

Точное время возникновения фамилии установить сложно: процесс закрепления фамилий растянулся на несколько столетий. Однако можно уверенно сказать, что корень «комыш» (камыш) нередко встречается в топонимах Полтавщины и Черниговщины — болотистые поймы рек давали много названий, связанных с этой растительностью.