Фамилия Комыспаева — редкая, с прозрачной, но неочевидной на первый взгляд внутренней формой. Её основа, «Комыспай», почти наверняка восходит к тюркскому составному имени или прозвищу. Первая часть, «комы» (или «кумы»), в тюркских языках может означать «песок», «песчаный», а в переносном смысле — «светлый», «желтоватый» (ср. казахское «құм» — песок). Вторая часть, «спай» — это искажённое «бай» (богатый, хозяин, господин), характерное для многих тюркских фамилий. Оглушение «б» в «п» после глухого согласного («с») — типичный фонетический процесс в разговорной речи.

Таким образом, исходное имя Комыспай (Комысбай) могло означать «песчаный (светлый) богач» или «богатый песками». Прозвища с элементом «бай» в кочевых обществах были распространены: они указывали не столько на реальное богатство, сколько на пожелание достатка или на характер — «хозяин», «предводитель». Фамилия образована по самой распространённой в русском языке модели: к основе прибавлен суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного), а окончание -а указывает на женскую форму. В русской традиции фамилии на -а часто закреплялись за женщинами из тюркоязычных регионов, где фиксация фамилии шла по женской линии или через мать (в метрических записях).

Географически фамилия тяготеет к Казахстану и сопредельным областям России (Оренбуржье, Астраханская область), а также к тем регионам Средней Азии, где проживают казахи. Среди носителей фамилии встречаются люди, чьи предки занимались скотоводством, кочевали в полупустынных зонах. Встречается также вариант Комысбаев, который ближе к исходной тюркской форме. Корень «комыс» не следует путать с русским «комыс» (вид камыша) — это случайное звуковое совпадение. Смысл фамилии — не в растении, а в песке и степи.