Фамилия Комысова — женская форма, а её мужской вариант Комысов встречается значительно реже. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Комыс, которое, скорее всего, связано с диалектным словом «комыс». В русских говорах Сибири и Урала так называли болотную кочку, поросшую мхом или осокой, а также сам мох. Человек мог получить прозвище Комыс за коренастое телосложение, за привычку носить неопрятную, торчащую одежду или за сходство с моховой кочкой — по ассоциации с чем-то рыхлым, неровным.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркским «камыс» (тростник, камыш) — в южнорусских и казачьих областях прозвище Камыс или Комыс могло закрепиться за человеком, жившим у зарослей камыша. Однако для фамилии Комысов тюркский след слабее, так как замена «а» на «о» в корне характерна для северорусского аканья, а не для южных говоров.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель XVI–XVII веков: Комысов — сын Комыса. Фамилия могла оформиться в крестьянской или мещанской среде, где прозвища были особенно живучи. Встречается она преимущественно в Поволжье и на Урале, что подтверждает связь с местной диалектной лексикой. Среди известных носителей — спортсменка Елена Комысова, но в целом фамилия редкая и не имеет широкой географии.