Фамилия Конаплин — редкая и неочевидная. На первый взгляд в ней слышится что-то иноязычное, но если присмотреться, корень оказывается вполне русским, хоть и диалектным.

Основа фамилии — слово «конаплый» или «конапливый». В северных и сибирских говорах так называли человека медлительного, нерасторопного, «копуна». Глагол «конать» означал «медлить, возиться, делать что-то слишком долго». Сравните с однокоренными фамилиями Конаков, Конанов, Конарев, где корень тот же, но суффиксы разные. Формант -ин в фамилии Конаплин указывает на принадлежность: «чей?» — конаплин, то есть сын или потомок Конапла. Первоначально это было прозвище Конаплый — вялый человек, которого всё время подгоняли.

Версия о тюркском происхождении (например, от слова «конак» — гость, постоялец) маловероятна: для неё нет ни типичной тюркской основы, ни характерного суффикса. Фамилия явно славянская по модели образования, хоть и редкая.

Встречается Конаплин в основном на Русском Севере и в Поволжье, где диалектная лексика сохранилась лучше. В дореволюционных переписях единичные носители зафиксированы в Вологодской и Вятской губерниях. Сословно — почти наверняка крестьяне или мещане, никакого дворянства.

У фамилии есть орфографическая особенность: в старых документах её могли писать как Конаплин, так и Конаплын — через «ы», что точнее передавало произношение прозвища. Но в современном написании закрепился вариант с «и».