Фамилия Конюшкина в своей основе хранит не профессию или прозвище, а имя — Конюшка. Это ласкательная или обиходная форма целого ряда крестильных имён: Конон (с греческого — «трудолюбивый» или «поспешающий»), Константин (латинское «стойкий, постоянный») или Кондратий (от лат. «квадратный», то есть широкоплечий). Выбор конкретного имени-прототипа теперь установить невозможно, но все они были распространены в среде крестьян и мещан, что указывает на простое сословие основателя рода.

Модель образования фамилии типична для северных и центральных областей России: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Конюшки). Притяжательная форма Конюшкин со временем закрепилась как фамильное прозвание, а женский вариант Конюшкина (через -а) стал использоваться либо как форма для замужней женщины, либо как исходная фамилия рода, если документально зафиксирована в женском роде.

Интересно, что фамилия Конюшкин (и её женская форма) встречается реже, чем созвучные Конюхов и Конюшенков, которые прямо связаны с конюшней и уходом за лошадьми. В отличие от них, Конюшкина — это не ремесленная, а «именная» фамилия, отходящая от личного имени. Таким образом, предки носительницы этой фамилии не обязательно были конюхами — скорее, их звали Конюшкой в быту, сокращая одно из полных церковных имён.