Фамилия Конюшкин образована от имени Конюшка. Это не отдельное имя, а уменьшительно-ласкательная форма от одного из крестильных имён: Конон (от греческого «трудолюбивый»), Константин (от латинского «стойкий, постоянный») или Кондратий («квадратный, широкоплечий»). В быту такие сокращения были привычны: от громоздкого церковного имени делали удобный домашний вариант, а уже от него закрепляли фамилию.

В словообразовании фамилии работает суффикс -ин, характерный для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я. Если бы исходное имя звучало как Конюшко, то фамилия стала бы Конюшков, но здесь форма женского или ласкательного рода дала именно Конюшкин. Эта модель типична для фамилий, возникших в среде, где человека называли по имени в бытовом, неофициальном обличье.

Стоит отметить, что существует и другая, менее вероятная версия: связь с профессией конюха. В говорах конюшкой могли называть работника при лошадях, и прозвище Конюшка могло закрепиться за человеком по роду занятий. Однако ономастика чаще связывает фамилию с личным именем — для прозвищной версии ожидалась бы форма Конюхов или Конюшев, а суффикс -ин здесь скорее указывает на «сына Конюшки», то есть потомка человека с таким именем.

Географически фамилия Конюшкин встречается в центральных и северных областях России, где были распространены имена Константин и Конон. В архивных записях XIX века носители фамилии числились среди крестьян и мещан — сословный состав типичен для фамилий, возникших на основе уменьшительных имён, а не дворянских родов.

Таким образом, Конюшкин — это фамилия, берущая начало от домашнего имени, которое когда-то носил предок. Сегодня она сохраняет память о том, как в русской деревне или городе сокращали и упрощали полные церковные имена, превращая их в повседневные прозвища.