Фамилия Корпунков образована по продуктивной русской модели с суффиксом -ов-, который вносит значение принадлежности: «чей?» — Корпунков, то есть сын или потомок Корпунка. В основе лежит прозвище Корпунок. Это уменьшительная форма от слова «корпун» — так в южнорусских и украинских говорах называли коршуна. Птица эта в народном сознании ассоциировалась с хищностью, зоркостью, но чаще — с неопрятностью и крикливостью. Прозвище могли дать человеку суетливому, драчливому или, наоборот, внешне похожему на коршуна: с крючковатым носом и цепким взглядом.

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. В рязанских и тамбовских говорах «корпун» означало не птицу, а горбатого или сгорбленного человека. Слово родственно диалектному «корпеть» — гнуть спину над работой. В этом случае Корпунок — это не столько обидное прозвище, сколько бытовая характеристика: человек, постоянно согнувшийся за ремеслом, возможно, портной или сапожник. Учитывая, что фамилия встречается преимущественно в центральных и южных областях России (Тульская, Орловская, Липецкая области), обе трактовки корня имеют под собой почву.

Словообразовательная модель типична для фамилий, возникших в среде крестьянства и посадских людей в XVI–XVII веках: сначала прозвище (Корпунок), затем его патронимическая форма. Суффикс -ок- в середине фамилии (Корпун-ок-ов) — редкий случай, когда уменьшительная основа сохранилась в полном виде, не стёрлась до «Корпунов». Это делает фамилию более выразительной и отличимой от однокоренных Корпуновых, Корпуненко или Корпунских.

В составе фамилии нет указания на сословие: Корпунковыми могли быть и крестьяне, и однодворцы, и мещане. В документах XIX века фамилия фиксируется в основном в среде государственных крестьян и бывших военных поселян. Известных носителей с общероссийской славой нет, что типично для фамилии локального бытования, не попавшей в дворянские родословные книги.