Фамилия Костицина, как и фамилии Костин, Костеев или Костюгин, относится к группе «костяных» — то есть образованных от слов, связанных с костью. В её основе лежит прозвище Костица. Скорее всего, его давали очень худому, костлявому человеку: такая внешняя черта сразу бросалась в глаза и легко закреплялась в быту.

Но у этого прозвища есть и вторая версия происхождения. На Руси Костицей могли назвать заядлого игрока в кости — старинную азартную игру. Позже значение расширилось, и прозвище перешло на страстных картёжников. Оба варианта правдоподобны, и без точных сведений о конкретном предке выбрать между ними сложно.

Сама фамилия образована по типичной русской модели: к основе Костиц- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. Костицин — буквально «сын Костицы». Со временем написание могло меняться, и в женском роде закрепилась форма Костицина. Такая модель встречается реже, чем фамилии на -ов, но тоже вполне обычна для северных и центральных областей России.