Фамилия Костыкин — один из тех случаев, когда за привычным звучанием может скрываться не одна, а как минимум две равноправные версии происхождения. И обе они связаны с разными сторонами жизни русского крестьянина или горожанина: одна — с ремеслом и бытом, другая — с обидным прозвищем и внешностью.

Основа фамилии — слово «костык». В русских говорах так называли не только трость для ходьбы, но и самодельный деревянный костыль, на который опираются при переломе ноги. Отсюда первая, «ремесленная» версия: Костыкиным могли прозвать мастера, который делал такие костыли, или человека, который ходил с костылём и получил прозвище по этой примете. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Костыки, то есть потомок человека с таким прозвищем.

Вторая версия выводит фамилию из диалектного слова «костык» в значении «упрямый, строптивый человек». В некоторых областях так говорили о том, кто «стоит на своём, как колом подпёртый». Если это так, то фамилия Костыкин — из разряда «характерологических» прозвищ, которые давали за поведение. В пользу этой гипотезы говорит то, что у фамилии есть однокоренные «собратья»: Костылёв, Костылев, Костылин. Последняя, кстати, известна по литературе — фамилия персонажа «Кавказского пленника» Толстого, где она, скорее всего, обыгрывает именно значение «неповоротливый, тяжёлый на подъём».

Географически фамилия Костыкин встречается в центральных и северных областях России, в том числе в Костромской и Вологодской губерниях, где слово «костык» в значении «костыль» было особенно употребительно. Встречаются и варианты написания — Костыкин и Костыкин, но с одной буквой «с» написание закрепилось как нормативное.

Если выбирать между двумя версиями, то более правдоподобной выглядит первая — по роду занятий или по физической примете. Прозвища по внешним признакам и профессиям в русской ономастике встречаются чаще, чем прозвища по чертам характера, и они обычно легче переходят в фамилии. Впрочем, в разных семьях история могла сложиться по-своему: в одной фамилия пошла от мастера-костыльника, в другой — от упрямого деда.