Фамилия Костыко — редкий пример, где суффикс помогает разобраться в происхождении быстрее, чем корень. Окончание -ко — типичный украинский или белорусский суффикс, который часто добавляли к прозвищам или именам, чтобы образовать фамилию. В данном случае основа «Косты-» может восходить к нескольким источникам, и самый прямой из них — прозвище Коста (или Кость).

Сам корень «кост-» в восточнославянских говорах имел два основных значения. Первое — прямое, связанное со скелетом: так могли прозвать очень худого, костлявого человека. Второе — переносное: «костью» в некоторых диалектах называли упрямого, несговорчивого человека (отсюда выражение «костный ум»). Если фамилия образована от уменьшительной формы личного имени Константин (Коста, Костя), то суффикс -ко указывает на «сына Кости» или «человека из рода Кости». Однако в случае с Костыко более правдоподобна версия с прозвищем: основа «Косты-» встречается в старых актах как самостоятельное прозвище (например, в писцовых книгах XVI века упоминается крестьянин Костыга).

Есть и менее очевидная, но интересная версия: связь с диалектным глаголом «костыкать» — хромать, припадать на ногу. В этом случае Костыко — прозвище хромого человека, которое затем закрепилось за его потомками. Такое слово действительно бытовало в южнорусских и украинских говорах.

С географической точки зрения фамилия Костыко почти не встречается в северных русских областях и редко — в центральных. Основной ареал — западные регионы: Брянская, Смоленская области России, а также восток Беларуси (Могилёвская, Гомельская области) и север Украины. Это подтверждает украинско-белорусское происхождение суффикса.

Сословно фамилия не несёт следов дворянства или духовенства. Скорее всего, первые носители — крестьяне или казаки. Фамилия не имеет «гнезда» однокоренных вариантов с другими суффиксами (Костыгин, Костылев), что говорит о её локальном, а не общерусском бытовании. В современных базах данных Костыко встречается редко, что делает фамилию хорошим маркером региональной принадлежности предков.