Фамилия Котохува — настолько редкая, что её обладатели, скорее всего, могут пересчитать друг друга по пальцам. Главная загадка здесь — корень. В русском языке нет ни слова «котохуй», ни близкого к нему по звучанию прозвища. Поэтому первая и самая очевидная версия — фамилия не русская по происхождению, а переосмысленная на русской почве.

Скорее всего, исходная форма звучала иначе и была адаптирована при записи в церковных книгах или при переезде. Например, это могла быть тюркская или кавказская фамилия, где основа «кот» или «кут» (счастье, дух, благодать) соединялась с «хува» (воздух, ветер, или же имя собственное). У народов, исповедующих ислам, распространены имена с компонентом «Хува» (одно из имён Аллаха). Если писарь записывал на слух фамилию вроде «Кутухова» или «Котыхова», то в русской графике она легко могла превратиться в «Котохува» — из-за акающего произношения и желания придать окончанию привычный вид фамилий на -ов/-ев.

Вторая, менее вероятная версия — чисто прозвищное происхождение от глагола «котохуйничать» (бездельничать, валять дурака). Такие глаголы бытовали в диалектах, но фамилии от них обычно образовывались с суффиксом -ин (Котохуин) или -ов (Котохуев). Форма на -а встречается реже и характерна для украинского или белорусского ареала, где ударение падает на последний слог.

Географически фамилия Котохува, вероятнее всего, привязана к югу России, Поволжью или Северному Кавказу — зонам активного контакта славянского и тюркского населения. Суффикс -ов указывает на принадлежность (чей? — сын Котохува), что типично для русской модели фамилий, но сама основа явно пришлая. Так что предки носителя этой фамилии, скорее всего, были крещёными инородцами или переселенцами из регионов, где русские фамилии давали по отцу, переделывая его нерусское имя на славянский лад.