Фамилия Ковальковский — классический пример того, как ремесло предков закрепилось в родовом имени. В её основе лежит украинское, белорусское или южнорусское слово «коваль», то есть кузнец. Кузнечное дело на Руси было одним из самых уважаемых, а самих кузнецов было так много, что фамилии от этого корня встречаются повсеместно: Ковалёв, Ковальчук, Коваленко, Коваль.

Однако суффикс -ский указывает на иной путь образования. Такая модель чаще встречалась у польской и западнорусской шляхты, а также у духовенства. Фамилии на -ский нередко давали по названию имения или местечка: если село называлось Ковальково, то его владелец или выходец оттуда становился Ковальковским. Вторая версия — прозвище «Ковальковый» могло означать сына кузнеца (Коваль → Ковалько → Ковальковый), и уже от этого прозвища через суффикс -ский образовали фамилию, подражая дворянскому звучанию.

Исходное прозвище Ковальковый, скорее всего, закрепилось за человеком, чей отец был кузнецом. Со временем потомки этого человека, желавшие подчеркнуть свой статус или перешедшие в служилое сословие, оформили фамилию по польскому образцу — Ковальковский. Так ремесленное прозвище обрело аристократическое окончание, но сохранило память о предке, работавшем у горна.