Фамилия Койсин — редкая, но в ней хорошо читается северная русская история. Её основа — не крестильное имя и не профессия, а прозвище, и разобраться в нём помогает география.

Скорее всего, фамилия происходит от прозвища Койса. В архангельских и поморских говорах «койса» — это невысокая, корявая сосна или ёлка, растущая на болоте. Человека могли прозвать Койсой за внешнюю угловатость, сутулость или за характер — «корявый», неуживчивый. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Койсин — «сын Койсы», «из рода Койсы». Такая модель типична для северных территорий, где фамилии часто возникали из внутрисемейных прозвищ и закреплялись в XVI–XVII веках.

Есть и другая, менее вероятная версия: Койса — это искажённое финно-угорское имя или прозвище (например, от карельского «koivu» — берёза). Но для русского Севера, где смешение с финно-уграми было обычным делом, такое объяснение не исключено, хотя и уступает «сосновому» по частоте встречаемости в документах.

Фамилия Койсин практически не встречается за пределами Архангельской области и соседних районов Карелии. Это локальный вариант, не распространившийся широко. В старых метрических книгах по Шенкурскому и Холмогорскому уездам можно найти Койсиных — крестьян и мещан, живших на одном месте поколениями.

Таким образом, Койсин — это фамилия-прозвище, связанная с природой и бытом русского Севера, где человека называли не по отцу, а по меткой примете.