Фамилия Козишникова — женская форма фамилии Козишников, и её разбор заставляет заглянуть в очень конкретный уголок русской ономастики — в мир профессиональных прозвищ, связанных с обработкой кожи и меха. Основа здесь не «коза» в прямом смысле, а производное от слова «козёл» или «козий» с характерным суффиксом -ишн-.

Суффикс -ишн- в фамилиях встречается редко и почти всегда указывает на принадлежность к ремеслу или мастерству. Если у нас есть основа «коз-», то логично предположить, что «козишник» — это не пастух (пастуха назвали бы Козопасом или Козловым), а человек, работающий с козьей шкурой, мехом или кожей. В говорах и старых промыслах «козишник» мог означать скорняка, выделывающего козлиные шкуры, или мастера, шьющего из них одежду, рукавицы, обувь. Прозвище закрепилось за конкретным человеком: «Иван, козишник» — то есть Иван-кожевник по козьему сырью.

Фамилия Козишниковых географически тяготеет к центральным и северным областям России, где был развит кустарный кожевенный промысел. В документах XVII–XVIII веков можно встретить упоминания «козишников» в ямских слободах и посадских общинах — это были не дворяне, а мастера, чей труд ценился, но не давал привилегий. Суффикс -ов в мужской форме (Козишников) — стандартный патронимический, указывающий на прямую наследственность: «сын козишника».

Интересная деталь: фамилия могла возникнуть и в среде старообрядцев, где ремесленные прозвища нередко заменяли церковные фамилии. В некоторых говорах «козишник» — это ещё и пренебрежительное название человека с козлиной бородкой, но для фамилии такая версия менее вероятна: прозвище по внешности давали реже, чем по занятию, и оно бы скорее дало форму Козлов или Козлин. Так что основная версия — ремесленная, и она самая надёжная.

Носительницы фамилии Козишникова могут считать, что их предки были мастерами по выделке козьей кожи — не самыми богатыми, но уважаемыми в своей среде людьми, без которых не обходился ни один рынок или ярмарка.