Фамилия Козляковский — одна из тех, где исходное прозвище не лежит на поверхности, и у специалистов нет единого мнения о его корне. В споре сходятся две основные версии, и обе по-своему логичны.

Первая версия связывает прозвище Козляк с грибным миром. В славянских говорах «козляком» (или «козляником») называют съедобный гриб из рода моховиков — с красновато-желтой или буро-желтой шляпкой. Прозвище Козляк могли дать заядлому грибнику или, наоборот, большому любителю грибных блюд. В этом случае фамилия оказывается «профессиональной» по происхождению, хотя и не в прямом смысле ремесла, а скорее по склонности или занятию.

Вторая версия уводит в мир древних славянских имён-оберегов. Слово «козляк» могло быть производным от «козёл» — животного, которое в народной культуре имело двойственное значение (и как символ плодородия, и как оберег от сглаза). Мирским именем Козляк родители могли наречь ребёнка, желая, чтобы природа приняла его как своего, а к малышу перешли жизненная сила и выносливость, приписываемые козлу. Такие имена от названий животных были распространены у славян до наступления эпохи христианских имён.

Словообразовательная модель фамилии типична для польской, украинской и западнорусской знати: суффикс -ский указывал на принадлежность к месту или роду. Изначально Козляковский — это, скорее всего, прозвище владельца хутора или усадьбы Козляково (Козляки). То есть сначала возникло название поселения или владения (от прозвища первопоселенца Козляк), а затем — фамилия его потомков. Такие фамилии на -ский в XVI–XVII веках часто получали шляхтичи и казацкая старшина, хотя со временем они распространились и среди крестьян, особенно после отмены крепостного права.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Козлов, Козляков, Козельский) показывает, что Козляковский стоит особняком: в нём нет прямого указания на животное (как в Козлове), а есть промежуточная ступень — «козляк», которая и порождает двойное толкование. Из двух версий грибная выглядит чуть правдоподобнее для прозвища взрослого человека, а «козлиная» — для древнего мирского имени. В любом случае, точное значение сегодня восстановить невозможно, но обе гипотезы дают представление о том, как формировалась эта редкая и звучная фамилия.