Фамилия Козуненко звучит как типичная украинская фамилия, и это первая подсказка. Модель образования проста и прозрачна: суффикс -енко, который в украинской ономастике означает «сын» или «потомок» (аналог русских фамилий на -ов). Основа здесь — Козун-. Это усеченная или ласкательная форма от имени или прозвища, которое, в свою очередь, восходит к слову «козёл».

Самый прямой путь: прозвище Козун (или Козунь) могли дать человеку, который чем-то напоминал козла — упрямством, бородкой, манерой бодаться, а может, и просто пас коз. В украинских говорах слово «козун» могло звучать как вариант слова «козел» или быть производным от глагола «козувати» (строить из себя важного, задирать нос). Соответственно, Козуненко — это «сын Козуна», то есть потомок человека с таким прозвищем.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых регионах Украины (особенно на Подолье и Волыни) «козун» — это диалектное название гриба-дождевика, который в сухом виде лопается и выпускает пыльцу. Прозвище могли дать по сходству: либо человек был круглым и приземистым, либо занимался сбором или продажей таких грибов. Версия с прозвищем от животного все же правдоподобнее — она встречается у большинства «козлиных» фамилий (Козлов, Козленко, Козуб), а грибная этимология слишком редка и локальна.

Географически фамилия Козуненко сосредоточена в центральной и восточной Украине, особенно в Черкасской, Полтавской и Киевской областях. Это говорит о том, что фамилия сформировалась в среде казацкой или крестьянской вольницы, где прозвища были живыми и конкретными, а не книжными. В Российской империи носители фамилии чаще всего числились в сословии казаков или государственных крестьян, реже — мещан.

Интересно, что фамилия Козуненко не имеет «двойников» с другим суффиксом (например, Козунов или Козунин) — это значит, что модель на -енко закрепилась за этой основой окончательно и почти не варьировалась. В отличие от фамилии Козубенко (где основа «козуб» — корзина), Козуненко однозначно отсылает к образу животного, а не к предмету быта.