Фамилия Козунов — одна из тех, что построены по древнейшей славянской модели: от мирского, нецерковного имени. В основе лежит имя Козун, которое, в свою очередь, восходит к слову «коза». Такие имена, как Коза, Козёл, Козун, были распространены на Руси задолго до повсеместного введения фамилий.

Смысл такого имени — не обида и не характеристика человека, а оберег. Давая ребёнку имя Козун, родители словно «прятали» его от злых сил, показывая: это не человек, а животное, своё для природы. Считалось, что вместе с именем к ребёнку перейдут и качества «тёзки» — выносливость, жизнестойкость, плодовитость. В крестьянской среде коза была символом не капризности, а скорее живучести и кормилицы.

Суффикс -ун- в имени Козун — редкая и интересная деталь. В русском языке этот суффикс часто придаёт слову оттенок деятеля или носителя признака (например, «говорун», «бегун»). Козун могло означать не просто «коза», а «тот, кто похож на козу» или «пастух коз». Впрочем, в личных именах этот суффикс встречается реже, чем в прозвищах, и здесь он, скорее всего, просто ласкательная или уменьшительная форма от Коза.

Фамилия Козунов образована по стандартной патронимической схеме: «чей?» — Козунов, то есть сын Козуна. Суффикс -ов принадлежит к самой массовой модели русских фамилий, указывая на принадлежность отцу. Со временем имя отца забылось, а фамилия закрепилась за родом.

Встречается фамилия Козунов в основном в центральных и южных регионах России, а также на Украине. По данным переписей, она не относится к числу очень частых, но и не является уникальной — её носители живут в разных областях, что говорит о том, что имя Козун когда-то было распространено довольно широко, но не стало «модным».

Если сопоставить с однокоренными фамилиями — Козин, Козлов, Козаков, — то Козунов стоит особняком. В отличие от Козлова, где основа — животное напрямую, и от Козина, где возможна связь с уменьшительным Козя, Козунов отсылает именно к личному имени с редким суффиксом. Это делает фамилию более «индивидуальной»: она не описывает занятие или внешность предка, а прямо называет его по мирскому имени-оберегу.

Таким образом, фамилия Козунов хранит память о древнем обычае называть детей в честь животных — не из прихоти, а по глубокому народному убеждению, что так ребёнок будет под защитой природы.