Фамилия Козынцев — один из тех случаев, когда написание искажает очевидный корень. Если смотреть на букву «ы», кажется, что в основе лежит что-то вроде «козын» или «козынь». Но на деле перед нами типичная русская фамилия с суффиксом -ев, где произошло фонетическое изменение: звук [о] под ударением перешёл в [ы] после твёрдого согласного. Изначально фамилия звучала как Козонцев или Козанцев, а на письме закрепилась форма Козынцев.

Основа — прозвище Козонец или Козанец. В русских говорах «козан» или «козон» — это бабка, игральная кость (например, в игре в бабки). Прозвище Козонец могли дать заядлому игроку, либо человеку, который делал такие кости, либо тому, кто был чем-то похож на эту кость — например, сутулый или коренастый. Другая версия: «козан» в диалектах означало и козла, и упрямого человека, но это менее вероятно, так как суффикс -ец в основе указывает на предметный, а не на животный мир.

Суффикс -цев — типично русский патронимический, указывающий на принадлежность: «чей?» — Козынцев, то есть сын или потомок Козынца (произносительного варианта от Козонца). Такие фамилии активно формировались в XV–XVII веках в центральной России и на севере. Географически Козынцевы чаще встречаются в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает связь с диалектным словом «козон» — в этих краях игра в бабки была широко распространена.

В отличие от фамилий Козлов или Козин, где корень прозрачен, Козынцев — пример того, как живая устная речь изменила облик фамилии. Письменная фиксация закрепила то самое «ы», которое сегодня сбивает с толку. Если ваш предок носил эту фамилию, он, скорее всего, не был связан с козлами, а либо увлекался народной игрой, либо имел характерное телосложение — и его прозвище передалось детям через три столетия.