Фамилия Кпустин — редкий случай, когда написание настолько необычно, что сразу наталкивает на вопрос: не ошибка ли это? Первое, что приходит в голову: возможная опечатка или искажение более распространённой фамилии Капустин. Но если отбросить версию про случайную потерю буквы «а», перед нами самостоятельная фамилия с собственной логикой.

Корень здесь — «кпуст-». В русском языке такого слова нет, но можно предположить, что в основе лежит диалектное или искажённое «капуст-». В говорах, особенно северных и сибирских, редукция гласных или их выпадение в безударном положении — явление нередкое. Если предок был прозван «Кпуста» (вместо «Капуста»), то фамилия образовалась по стандартной модели: прозвище + суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «Кпустин»). Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от основ на -а, -я.

Прозвище Капуста (и его варианты) в старину давали либо человеку, который выращивал или торговал капустой, либо, в переносном смысле, — медлительному, «кочанному» человеку, либо тому, кто носил шапку, похожую на кочан. Ономаст Б. Унбегаун в своём «Словаре русских фамилий» упоминает фамилию Капустин как типичную «овощную». Кпустин — её диалектный или канцелярский дубль.

Географически фамилия Кпустин крайне редка. Основные носители встречаются в центральных областях России, но единично. В дореволюционных переписях и метрических книгах такое написание могло возникнуть из-за неграмотности писаря или местного произношения: «Капустин» могли записать на слух как «Кпустин», особенно если в говоре первый слог редуцировался почти до нуля.

Таким образом, Кпустин — это, скорее всего, вариант-дубль фамилии Капустин, закреплённый в документах из-за фонетических особенностей речи или ошибки. Носитель такой фамилии может считать себя обладателем уникального письменного слепка живой народной речи прошлого.