Фамилия Краснипонский — редкая и необычная по своему строению. В первую очередь бросается в глаза суффикс -ский, типичный для польской шляхты и русского духовенства. Однако основа, от которой образована фамилия, неочевидна и допускает несколько толкований.

Самый прямой разбор — сложение двух корней: «красн-» и «-пон-». Первый корень, «красн-», в древнерусском языке означал не только цвет, но и «красивый», «хороший», «парадный» (отсюда «красна девица», «Красная площадь»). Второй корень, «пон-», может восходить к слову «понява» — так в южных и западных русских говорах называли домотканую шерстяную юбку, часть традиционного женского костюма. В таком случае Краснипонский — это фамилия, данная человеку, носившему или делавшему «красную понёву», то есть красивую праздничную одежду. Это объяснение выглядит правдоподобным, если учесть, что фамилии на -ский часто образовывались от прозвищ, указывающих на характерную деталь внешности или быта.

Менее вероятная, но возможная версия — топонимическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Красный Пон или Краснопонье. На картах такие пункты не зафиксированы, но в регионах с польским или украинским влиянием (например, на Волыни или в Подляшье) название могло существовать в устной традиции и не попасть в официальные справочники. Суффикс -ский в этом случае указывал бы на дворянское или шляхетское происхождение: «владелец (или выходец) из Красного Пона».

Особенность фамилии — её редкость. В современных базах данных она практически не встречается, что говорит либо о её угасании, либо о сильном искажении при переписях. Возможно, первоначальное написание было «Краснопонский» (с соединительной «о»), а «и» появилось в результате диалектного произношения или ошибки писаря. Сравните с более распространёнными фамилиями той же модели: Красносельский, Краснопольский — они явно топонимические. Краснипонский же стоит особняком, и его связь с одеждой (понёвой) кажется наиболее живой и конкретной.