Фамилия Криштофенко — яркий пример украинской модели фамилии на -енко. Такие фамилии (Петренко, Шевченко, Коваленко) исторически означали «сын такого-то» или «потомок», а в более широком смысле — «человек, принадлежащий к роду». Криштофенко, соответственно, означает «потомок Криштофа».

Основа фамилии — имя Криштоф. Это народная, восточнославянская форма церковного имени Христофор (от греч. Христофорос — «несущий Христа»). В украинской и белорусской традиции начальное «Христо-» часто переходило в «Кришто-» под влиянием польского языка (Krzysztof). Такое написание — Криштофенко, а не, скажем, Христофоренко — прямо указывает на западнорусское или польское посредничество. Фамилия закрепилась в тех регионах Украины и Беларуси, где было сильным польское культурное влияние: на Волыни, Подолье, в Галиции.

Интересно, что имя Христофор в народной среде было редким, чаще встречалось у духовенства или шляхты. Поэтому Криштофенко — не фамилия крестьянская, а скорее казацкая или мещанская. Её носитель в XVII–XVIII веках мог быть реестровым казаком, мелким торговцем или священником. Суффикс -енко в те времена был не просто патронимическим, но и социальным маркером: в Левобережной Украине и на Запорожье так образовывали фамилии люди свободного состояния, а не крепостные.

В отличие от более частых фамилий на -енко (Коваленко, Бондаренко), Криштофенко — редкая. Её редкость объясняется тем, что имя-основа никогда не было массовым. В современных украинских и российских справочниках фамилия встречается точечно, без чёткой географической концентрации. Правописание стабильно: Криштофенко не склоняется, ударение, скорее всего, на третьем слоге — Криштофе́нко, хотя в бытовой речи возможны варианты.