Фамилия Крученко образована от личного прозвища и относится к распространенному типу украинских фамилий, на что указывает суффикс -енко. Фамилия Крученко восходит к украинскому прозвищу Крученя. Подобным образом могли прозвать кривовго, "скрученного", сутулого человека. Не исключено, что прозвище Крученя принадлежало кучерявому, кудрявому молодцу. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Крученя, со временем получил фамилию Крученко.