Фамилия Крухтин — одна из тех, что заставляют задуматься о значении корня, а не просто скользнуть по нему взглядом. В основе лежит прозвище Крухта. В русских говорах, особенно северных и сибирских, «крухта» — это крошка, мелкий кусочек, крупица. Человека могли так прозвать за маленький рост, щуплое телосложение или, напротив, за чрезмерную мелочность и дотошность. Есть и вторая, менее распространённая версия: в некоторых диалектах глагол «крухтать» означал «кряхтеть», «охать» или «ворчать». Тогда прозвище Крухта давали тому, кто постоянно жаловался или тяжело вздыхал от работы.

Суффикс -ин указывает на патронимическую модель: Крухтин — это «сын Крухты». Такая форма типична для фамилий, образованных от слов с окончанием на -а, -я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречались в центральных и южных регионах, фамилии на -ин более характерны для севера России, Поволжья и Сибири, что косвенно подтверждает северное происхождение самого слова «крухта».

Любопытно, что фамилия Крухтин могла возникнуть не только из прозвища, но и из мирского имени. В древнерусской традиции существовали охранительные имена-обереги, которые давали детям от сглаза: называли Крошкой, Малышом, Крухтой, чтобы злые силы не позарились на ребёнка. Со временем такое имя закреплялось за родом и превращалось в фамилию. Сравните с однокоренными Крошкин, Крохин, Кротов — все они построены по той же модели и несут схожую смысловую нагрузку.

Встречается фамилия в основном на Русском Севере, в Вологодской и Архангельской областях, а также в Сибири, куда переселенцы принесли свой говор. Встретить Крухтина в южнорусских губерниях — редкость, что лишний раз подтверждает диалектную природу основы. Никакой связи с иностранными корнями или дворянскими титулами здесь нет: фамилия чисто крестьянская, простонародная, образованная от бытового слова, которое сегодня почти вышло из употребления.