Фамилия Кшишинская или Кшишинский — редкий случай, когда географическое имя почти не оставляет сомнений в происхождении. Основа здесь прозрачна: Кшиш — это фонетическая передача польского Krzysz (от Krzysztof, то есть Христофор). Суффикс -инский (польск. -iński) указывает на типичную для шляхты модель образования от названия поместья или местечка. Иными словами, первый носитель фамилии был либо владельцем, либо уроженцем населённого пункта, который назывался Кшиш или Кшишево. Такие топонимы встречаются в Польше, особенно в Малопольском и Подкарпатском воеводствах, где корень krzysz- в названиях деревень не редкость.

Написание «Кшишинский» — результат адаптации польского звучания к русской орфографии. В оригинале фамилия выглядела бы как Krzyszyński или Krzysiński, где сочетание rz даёт твёрдый звук «ш». При переходе в русскую среду сложное для произношения «кшш» упростили до «кши», а суффикс привели к привычному «-ский». Это типичная история для фамилий, попавших в восточнославянскую среду после разделов Речи Посполитой.

Социальный контекст тоже поддаётся реконструкции. Суффикс -инский в польской ономастике — маркер шляхетского происхождения, часто мелкопоместного. Владельцы одного фольварка или даже его части получали фамилию по названию имения, чтобы отличаться от крестьян той же деревни. Поэтому предок Кшишинских, скорее всего, был не магнатом, а застянковым шляхтичем — мелким землевладельцем, который служил в ополчении и платил подушный налог.

Встречаемость фамилии в России крайне низкая. По базам данных и телефонным справочникам, Кшишинские живут в основном в западных регионах — Калининградской, Псковской областях, а также в Москве и Санкт-Петербурге. Это коррелирует с послевоенными переселениями поляков и белорусов. Другие версии — например, происхождение от прозвища Кшиш (от диалектного «кшивый» — кривой, косой) — менее вероятны, так как суффикс -ский для прозвищных фамилий нехарактерен.