Фамилия Кубиева — женская форма мужской фамилии Кубиев, и её происхождение напрямую связано с географическим названием. Основа фамилии — топоним Куба, и здесь сразу несколько вероятных путей. Самый очевидный и распространённый: город Куба на северо-востоке Азербайджана (историческая Кубинская провинция). Выходцы оттуда, переселяясь в другие регионы Российской империи, получали прозвище «Кубинец» или «Куба», которое затем закрепилось в фамилии. Второй вариант, менее известный, но тоже реальный: село Куба в Кабардино-Балкарии (близ Нальчика) или даже река Кубань — в народной речи её иногда сокращали до «Куба». Человека, живущего на Кубани, могли прозвать Куба, и отсюда пошла фамилия Кубиев.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Кубиев буквально означает «сын Кубы». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ или названий местности. Важно отметить, что фамилия Кубиев (и Кубиева) — не тюркская по форме, хотя её основа тюркского или кавказского происхождения. Она адаптирована через русскую словообразовательную модель: именно суффикс -ев, а не -ов, встречается у фамилий, основа которых заканчивается на мягкий согласный или на ц (в данном случае «Куб» + «ев»). Более редкая версия связывает фамилию с осетинским словом «куб» — «ковш» или «чаша», тогда прозвище Куба мог получить мастер-литейщик или человек с характерной формой головы, но эта гипотеза слабее, так как фамилия географически тяготеет к Кавказу и Закавказью, где топонимическое объяснение выглядит естественнее.

Социальный состав носителей фамилии разнороден: среди Кубиевых встречаются и крестьяне-переселенцы, и горские народы (осетины, кабардинцы), принявшие русскую фамилию при документальном оформлении в XIX веке. В осетинской среде, например, фамилия Кубиевых (Кубиатæ) — одна из распространённых в Дигорском ущелье, и там её связывают именно с названием села Куба (ныне не существующего) или с личным именем Куба. Таким образом, искать корни фамилии стоит либо на Северном Кавказе, либо в Азербайджане — и в обоих случаях основа одна: человек, чьи предки были родом из места с названием Куба.