Фамилия Кудактина — женская форма от Кудактин, а та, в свою очередь, принадлежит к редкому и интересному типу русских фамилий на -ин. Если отбросить суффикс, указывающий на принадлежность («чей?»), остаётся основа Кудакт- — личное прозвище или имя, которое и стало ключом к происхождению.

Самая вероятная версия связывает Кудакту с тюркским именованием Кудак (или Кудай). В тюркских языках «кудай» — бог, небо, высшая сила. Уменьшительно-ласкательная форма с аффиксом -та (Кудакта) могла означать «боженька», «божественный» или «данный богом». Такие имена-обереги были распространены у татар, башкир и других народов Поволжья и Урала: считалось, что назвав ребёнка «божеством», его защитят от злых духов. Русские, живя по соседству, нередко перенимали такие прозвища и превращали их в фамилии.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным русским словом «кудактать» — в некоторых говорах так говорили о суетливом, хлопотливом человеке, который «кудахчет» без дела. Однако эта версия слабее: фамилия географически тяготеет к регионам, где исторически сильны тюркские влияния (юг России, Зауралье), а не к северным говорам, где «кудактать» могло бытовать.

Фамилия Кудактина не относится к числу дворянских или широко распространённых. Её носители, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию от прозвища предка. Встречается она преимущественно в Удмуртии, Татарстане и Оренбургской области — то есть именно в зоне активного русско-тюркского пограничья.

Интересная деталь: форма на -ин вместо более частого -ов указывает на то, что прозвище Кудакта оканчивалось на -а (как в словах «сирота» или «слуга»). Это не типично для тюркских заимствований, которые обычно дают фамилии на -ов (например, Кудаков). Значит, либо прозвище было русифицировано и получило окончание -а, либо исходное тюркское имя уже звучало как Кудакта — с характерным для некоторых диалектов конечным гласным.