Фамилия Кудюрин образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы (личного имени или прозвища) с помощью суффикса принадлежности -ин. Этот суффикс указывает на то, что предок носителя фамилии был сыном или потомком человека по прозвищу Кудюра. Само прозвище Кудюра, скорее всего, связано с диалектным словом «кудюры» — так в некоторых русских говорах (особенно южных и рязанских) называли кудри, вьющиеся волосы. В таком случае Кудюра — это человек с кудрявой, вьющейся шевелюрой, и фамилия буквально значит «сын кудрявого».

Менее вероятна, но возможна связь с другим значением. В некоторых областях «кудюра» могло быть прозвищем для суетливого, непоседливого человека или того, кто постоянно «кудесит» — проказничает, устраивает путаницу. Однако основная версия, опирающаяся на звучание и распространённость «кудрявых» фамилий (Кудрявцев, Кудрин, Кудряшов), остаётся самой правдоподобной.

Особенность фамилии Кудюрин в том, что она сохранила древнюю диалектную форму корня. В литературном русском языке закрепилось слово «кудри», а в народной речи бытовали варианты «кудри» и «кудюры». Фамилия Кудюрин — прямое свидетельство этого живого произношения, которое не попало в словари, но осталось в родовом имени. Если сравнивать с однокоренной фамилией Кудрин, то Кудюрин — более редкий и локальный вариант, распространённый преимущественно в центральных и южных областях России, где диалектное «ю» вместо «и» было нормой.

Сословного барьера у фамилии не было: Кудюриными могли быть и крестьяне, и мещане, и служилые люди. Прозвище по внешнему признаку давали независимо от достатка. Встречаемость фамилии невысокая, что делает её ценной для генеалогического поиска: найти своих Кудюриных проще, чем обладателей массовых фамилий.