Фамилия Куджанова — женская форма фамилии Куджанов, которая образована по русской патронимической модели с суффиксом -ов. В основе фамилии лежит личное имя Куджан. Это имя составное, восточного происхождения, скорее всего тюркского или иранского корня. Первая часть «куд» может восходить к тюркскому «кут» (счастье, благодать, удача) или к персидскому «худ» (сам, свой). Вторая часть «жан» — распространённый иранский компонент, означающий «душа», «жизнь», часто встречающийся в именах (например, Реза, Фирузджан). Таким образом, Куджан могло означать «счастливая душа» или «сама душа» — ласковое, пожелательное имя.

География фамилии Куджановых указывает на Северный Кавказ и Поволжье, особенно на регионы с компактным проживанием тюркоязычных народов — татар, башкир, кумыков, ногайцев. Встречается фамилия и среди осетин, что объясняется длительными контактами с тюркским миром. В русскую фамильную систему имя Куджан вошло через крещение или через межэтнические браки, но чаще всего носители оставались мусульманами, поэтому фамилия фиксировалась в метрических книгах мусульманских приходов.

Суффикс -ов у фамилии Куджанов — стандартный для русских фамилий, но в данном случае он оформляет имя не славянского, а восточного происхождения. Это типично для фамилий, возникших в регионах, где русские фамильные модели накладывались на местные именники. Интересно, что ударение в фамилии падает на второй слог: КуджАнов, хотя в исходном имени КуджАн ударение также на последний слог, что сохраняет восточную интонацию.

Менее вероятна, но возможна версия, связывающая фамилию с прозвищем от слова «куджа» — так в некоторых тюркских диалектах называли кузнеца или ремесленника. Однако для такого прозвища нехарактерен суффикс -ан, который скорее указывает на имя, а не на профессию. Поэтому версия с личным именем Куджан надёжнее.

В дореволюционных документах фамилия могла писаться через букву «г» (Кугжанов) или с удвоенной «н» (Куджаннов), что связано с разным восприятием на слух долготы звука «ж». Такие варианты встречаются в переписях конца XIX века по Астраханской и Ставропольской губерниям. Сегодня фамилия Куджанова встречается нечасто, но сохраняет отчётливую привязку к восточному антропонимикону, что сразу говорит о происхождении предков.