Фамилия Кухтий — это яркий пример прозвища, которое перешло в наследственное имя. В её основе лежит древнерусское слово «кухта», которое в северных говорах означало «косматый иней на деревьях». Скорее всего, так могли прозвать ребёнка, родившегося в морозный зимний день, когда ветви стоят в пушистом серебре. Такие «природные» прозвища давали по случайному сходству или по обстоятельствам рождения — и они легко закреплялись в быту.

Есть и другая, бытовая версия. В новгородских диалектах существовал глагол «кухтаться» — «кутаться, тепло одеваться». Отсюда Кухтием могли назвать человека, который постоянно мёрз, кутался в одежду или просто был очень осторожным, «закутанным» в свои привычки. Прозвище Кухта встречается уже в исторических документах XVI века, что говорит о его давней традиции.

Сама фамилия образована с помощью типичного для украинских и южнорусских фамилий суффикса -ий (Кухт-ий). Такая модель (как у фамилий Шевченко — Шевчук, но с другим окончанием) часто указывает на украинское или белорусское происхождение. В русских землях аналогичное прозвище чаще оформлялось бы как Кухтин или Кухтов. Таким образом, фамилия Кухтий может указывать на предка из западнорусских или украинских областей, где подобные прозвищные формы были особенно распространены.