Фамилия Кулдыркаева образована от прозвища или некалендарного имени Кулдыркай. В её основе лежит тюркский корень «кулдыр», который в ряде тюркских языков (татарском, башкирском, казахском) означает «грохот», «шум», «громыхание». Суффикс -кай в тюркских именах и прозвищах — ласкательно-уменьшительный, придающий слову оттенок нежности или иронии. Таким образом, Кулдыркай — это человек, которого прозвали за шумный нрав, громкий голос или неугомонный характер, либо же это имя-оберег, данное, чтобы отвести от ребёнка злые силы: назвали «громким», а вырос тихим.

Русский суффикс -ев (в женском варианте -ева) указывает на принадлежность: Кулдыркаева — дочь или жена Кулдыркая. Фамилия закрепилась в среде крещёных татар, башкир или мишарей, а также у народов Поволжья и Урала, где тюркские имена активно переходили в русские фамилии. Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане, что подтверждает её региональные корни.

Менее вероятная версия связывает фамилию с диалектным русским словом «кулдык» — так в некоторых говорах называли калеку или человека с физическим недостатком. Однако тюркская этимология убедительнее: она объясняет и форму на -кай, и ареал распространения. В любом случае, предок носительницы фамилии был человеком заметным — либо по характеру, либо по внешности, и это прозвище закрепилось за его потомками.