Фамилия Кумеков ведет происхождение от прозвища Кумек. В его основе лежит тюркское слово «кум» — «песок», а суффикс -ек придает уменьшительно-ласкательный оттенок. Таким образом, Кумек означает «песочек». Скорее всего, прозвище указывало на место рождения предка — песчаную местность, либо на особенности внешности, например, светлые волосы или кожу. Модель образования фамилии проста: к основе Кумек добавили русский патронимический суффикс -ов, что типично для фамилий, возникших в среде, где русская административная традиция фиксировала имена по отцу.

История этой фамилии прослеживается по документам начала XVII века. Из московских посланий известен башчи мундусов Кумек Ентугаев, который остался со своим улусом в Сибири, в родных уделах, выделенных ханом Конаем младшему сыну Ентугаю. Позже Кумек Ентугаев получил титул зайсан. Его сын Буктуш Кумеков, как и отец, был непосредственно подчинен Джунгарскому хану и освобожден от уплаты налогов. Эта ветвь рода, судя по всему, имела привилегированное положение в кочевой иерархии.

В более позднее время фамилия фиксируется в Книге памяти Алматинской области: там упомянут директор начальной школы Кумеков Садык, родившийся в 1914 году в селении Агарту Саркандского района. Эта запись подтверждает, что к XX веку фамилия уже прочно закрепилась в казахской среде, а ее носители занимались мирными профессиями.