Фамилия Кундохова — женская форма фамилии Кундохов, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с основой. Это редкая фамилия, и её корень неочевиден. Скорее всего, в основе лежит прозвище или некалендарное имя Кундох, которое могло возникнуть из диалектного слова. В русских говорах, особенно на севере и в Сибири, «кунда» или «кундо» могло означать «коротышка», «невысокий человек» или, в некоторых контекстах, «неповоротливый, неуклюжий». Суффикс -ох- (как в словах «петух», «пастух») в прозвищах часто придавал оттенок характерности или пренебрежения: Кундох — это человек, обладающий свойством, названным корнем «кунд-».

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слово «кун» (солнце, день) и «дох» (родиться), но для фамилии Кундохов такое сложение нетипично, и звучало бы оно скорее как Кундогду или Кундузов. Поэтому версия с русским диалектным прозвищем выглядит убедительнее: фамилия образована по продуктивной модели «прозвище на -ох + патронимический суффикс -ов».

По географии фамилия встречается спорадически, преимущественно в центральных и южных регионах России, но без ярко выраженного гнезда. Это указывает на то, что носители, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды — фамилии на -ов у непривилегированных сословий закрепились в массе после отмены крепостного права в 1861 году. Если бы фамилия была дворянской, она, вероятно, сохранила бы более архаичную форму или была бы записана в родословных книгах, чего в данном случае не наблюдается.

Таким образом, предок современных Кундоховых, по всей видимости, получил прозвище Кундох за внешность или манеру поведения. Фамилия — редкий пример сохранения диалектного слова, которое почти исчезло из живой речи.