Фамилия Кундинова — женская форма фамилии Кундинов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Кунда. Основа здесь не самая прозрачная, и на этот счёт есть две версии, причём одна заметно убедительнее другой.

Самое вероятное объяснение: Кунда — это вариант тюркского имени Кундыз, что в переводе означает «бобр». В татарском, башкирском и казахском языках это слово звучит как «кондыз» или «кундыз». В русской среде, особенно в тех регионах, где тюркское и славянское население веками жило рядом (Поволжье, Приуралье, юг Сибири), такие имена легко адаптировались: отпадал конечный согласный, имя сокращалось до Кунда. Бобр в тюркской традиции — символ трудолюбия, хозяйственности и упорства, так что прозвище могло быть вполне лестным. Модель образования типична: основа Кунд- + русский патронимический суффикс -ин (чей? — сын Кунды), а затем фамилия приобрела женское окончание -а.

Менее вероятная версия отсылает к славянскому глаголу «кундеть» — в некоторых говорах он означал «ворчать, брюзжать» или «сидеть без дела, киснуть». Тогда Кунда — это прозвище ворчуна или медлительного человека. Однако эта гипотеза слабее: во-первых, глагол редкий и диалектный, во-вторых, фамилий с тюркской основой Кунд- на территории России значительно больше, чем со славянской. Словарь тюркских заимствований в русских фамилиях (работы Никонова, Баскакова) фиксирует множество примеров: Кундаков, Кундузов, Кундышев — все они восходят к «кундыз».

Географически фамилия Кундинова чаще всего встречается в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане — как раз в зоне активных русско-тюркских контактов. Также есть носители среди казахов и татар, что дополнительно подтверждает тюркскую версию происхождения.

Таким образом, предок современных Кундиновых, скорее всего, носил тюркское имя Кунда (сокращённое от Кундыз). Фамилия закрепилась в XVI–XVII веках, когда на южных и восточных рубежах России служилые люди и крестьяне смешанного происхождения получали фамилии по отцу. Никаких дворянских корней или громких исторических личностей за этой фамилией не числится — это фамилия крестьянская и казачья, каких тысячи, но с очень конкретной и ясной этимологией.