Фамилия Кунденко образована от прозвища Кунда. По одной из версий, в основе этого прозвища лежит польское слово kunda - «куница». Возможно, Кундой прозвали человека, чем-либо напоминавшего этого зверька (например, хитроватого, льстивого и т.д.). Согласно другой гипотезе, оно происходит от нижненемецкого слова kunde - «родной». Вероятно, так могли называть близкого родственника. Наконец, нельзя исключить, что фамилия Кунденко восходит к названию реки Кунда, протекающей в районе Финского залива. Позднее на берегу этой реки был основан город Кунда. Исходя из этой гипотезы, можно предположить, что предок обладателя данной фамилии был выходцем из города с таким названием. Сам же топоним, возможно, восходит к эстонскому слову kund, которое переводится на русский язык как «пашня». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кунда, со временем получил фамилию Кунденко. Так, в Книге памяти Самарской области записан украинец Кунденко Михаил Григорьевич, который родился в 1901 году в Харьковской губернии.