Фамилия Кундин образована от прозвища Кундя. Очевидно, оно восходит к существительному «куна» в значении «зверек, чей драгоценный мех служил для натурального обмена в Древней Руси, а затем появилась денежная единица «куна» (кунья мордка)». Менее правдоподобной представляется этимологическая связь фамилии с названием реки Кунда, протекающей в районе Финского залива. Исходя из этой гипотезы, можно предположить, что предок обладателя данной фамилии жил на берегу этой реки или в близлежащей местности. Скорее всего, предок человека с фамилией Кундин занимался добычей или продажей ценного меха, за что и получил прозвище Кундя. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кундя, со временем получил фамилию Кундин.