Фамилия Кункин — одна из тех, где на первый взгляд ясное звучание скрывает неожиданное разнообразие версий. Самая очевидная и, скорее всего, основная гипотеза — происхождение от прозвища Кунка. В русских говорах «кунка» — это ласкательное название куницы (от «куна»), ценного пушного зверька. Прозвище Кунка могли дать либо удачливому охотнику, либо хитрому, ловкому человеку, либо, что не менее вероятно, тому, кто торговал мехом. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Кункин, то есть сын или потомок Кунки.

Однако есть и вторая, менее распространённая, но лингвистически оправданная версия. В некоторых диалектах «кунка» означала короткую женскую шубку или безрукавку из куницы. В этом случае прозвище могло закрепиться за скорняком или портным, специализировавшимся на такой одежде. Оба варианта — и промысловый, и ремесленный — укладываются в логику русских фамилий, образованных от названий профессий и предметов быта.

Стоит упомянуть и редкую гипотезу, связывающую фамилию с древнерусским нецерковным именем Кунка. Такие имена от названий животных (Волк, Медведь, Сорока) были в ходу у славян до XVII века. Но в случае с Кункой это маловероятно: куница не была тотемным или частым личным именем, в отличие от тех же Волка или Зайца. Поэтому прозвищное происхождение выглядит убедительнее.

Географически фамилия Кункин встречается не повсеместно, а тяготеет к северным и центральным регионам России — бывшим территориям Новгородской и Вятской губерний, где куний промысел был развит исторически. Сословной привязки у неё нет: Кункиными могли быть и крестьяне, и посадские люди, и даже мелкие служилые. Фамилия не аристократическая, а народная, что делает её типичным образцом «ремесленной» ономастики.

В написании фамилия устойчива: двойное «н» — не ошибка, а закономерный результат присоединения суффикса -ин к основе на «к» (Кунк-а + ин). Вариант «Кунькин» (от «кунька») тоже существует, но встречается реже и указывает на иную фонетическую традицию. Таким образом, Кункин — это фамилия-профессия или фамилия-прозвище, напрямую связанная с пушным зверем, который кормил и одевал предков её носителей.