Фамилия Купчихины — редкий случай в русской ономастике, когда фамилия образована не от имени или занятия мужчины, а от прозвища его жены. В основе лежит слово «купчиха» — так в старину называли жену купца. Прозвище Купчиха могли дать женщине не только по мужу, но и по её собственному положению: вдова, унаследовавшая торговое дело, или женщина, сама державшая лавку. Потомки этой женщины со временем получили фамилию Купчихин (или, во множественном числе, Купчихины), что буквально означает «чьи? — купчихины дети».

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: суффикс -ин- указывает на принадлежность, как в фамилиях Мамин, сестрин, бабушкин. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ на -а/-я. Мужской род фамилии — Купчихин, женский — Купчихина, а форма множественного числа Купчихины закрепилась как общее родовое имя.

Само прозвище Купец, от которого пошло «купчиха», относится к так называемым «профессиональным» именованиям. Купцами в Древней Руси называли не только богатых торговцев, но и вообще людей, занятых куплей-продажей, включая мелких лавочников и разъездных продавцов. Поэтому предки Купчихиных могли быть как зажиточными горожанами, так и людьми скромного достатка, но обязательно связанными с торговлей.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, где суффикс -их-/-ых (Купчихины, Купчихин) встречается чаще, чем на юге. В старых переписных книгах и ревизских сказках можно встретить записи вроде «вдова купчиха Марья» или «Купчихин сын», что и закрепляло фамилию в документах.

Точное время возникновения фамилии назвать сложно: процесс формирования русских фамилий шёл несколько столетий, и окончательно они закрепились лишь к XIX веку. Однако ясно, что фамилия Купчихины — живое напоминание о торговом прошлом, о женщинах, которые стояли за купеческими лавками и вели хозяйство, пока мужья были в отъезде.