Фамилия Купис — редкая, но с прозрачной этимологией. В её основе лежит слово «купа», которое в древнерусском языке и диалектах означало «груда, куча, множество» или «совместное владение, складчина». Соответственно, прозвище Куп — или его уменьшительная форма Купис — мог получить человек, который что-то собирал, накапливал, либо участвовал в общем деле, совместном хозяйстве.

Словообразовательная модель указывает на то, что фамилия закрепилась в форме, типичной для западных и юго-западных регионов бывшей Речи Посполитой — Беларуси, Украины, восточной Польши. Суффикс -ис здесь не русский (сравните с -ов, -ин, -ский), а характерный для белорусской и польской ономастики: он передаёт принадлежность или уменьшительность. Таким образом, Купис — это, скорее всего, «сын Купа» или «маленький Куп», то есть потомок человека по прозвищу Куп.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с литовским словом kupė — «куча, стог». Это допустимо, если предки жили на этническом пограничье, в районах современной Литвы или Беларуси, где литовские и славянские корни переплетались. Но в целом славянское происхождение от «купы» выглядит более естественным и не требует дополнительных допущений.

Сословной привязки у фамилии нет: Куписом могли назвать и крестьянина, и ремесленника, и мещанина. Географически фамилия встречается в основном в Беларуси (особенно в Гродненской и Брестской областях) и в приграничных районах Польши. В России она редка и, как правило, появлялась в результате переселений.