Фамилия Купшан — редкая и нестандартная для русского слуха, что сразу наводит на мысль о нерусском происхождении. Скорее всего, она имеет тюркские или кавказские корни. В тюркских языках, например, в башкирском или татарском, слово «купшан» могло быть именем или прозвищем, образованным от глагола со значением «собирать», «копить» или «объединять». Возможна и связь с диалектным «купш» — так в некоторых говорах называли вид шубы или тулупа, что превращало Купшана в прозвище мастера-скорняка или человека, торгующего верхней одеждой.

Суффикс «-ан» в фамилии — характерный тюркский именной показатель, который встречается в личных именах (Айтуган, Сайфуллин) и фамилиях, адаптированных в русской среде без добавления стандартных русских окончаний -ов/-ев. Такая модель указывает, что фамилия могла закрепиться в форме личного прозвища или имени, которое не переделали на русский лад, а оставили как есть. Это часто происходило с выходцами из Башкирии, Татарстана или народов Северного Кавказа, где фамилии на «-ан» не редкость.

Встречается Купшан и в еврейской среде, особенно среди ашкеназов, но там она, вероятно, возникла как вариант фамилии Купшмидт или Купшман, где корень «купш» восходит к немецкому «Kupfer» (медь) или идишскому «kupets» (купец). В таком случае фамилия могла указывать на медника, торговца медью или просто купца. Однако для русскоязычного носителя более логичной выглядит версия с тюркским прозвищем, так как она объясняет и звучание, и отсутствие типичных для еврейских фамилий окончаний.

Географически фамилия Купшан встречается в рассеянном виде: единичные носители живут в Башкортостане, Татарстане, на Урале и в Западной Сибири. Встречается она и в Молдавии, что может быть связано с переселением гагаузов или болгар, у которых тоже есть фамилии с похожей структурой. Из-за редкости фамилии её точная этимология остаётся предметом догадок, но ясно одно: предки носителя Купшан, скорее всего, были людьми с ярким прозвищем, связанным либо с ремеслом, либо с характером, либо с местным диалектом.