Фамилия Курахтина — женская форма, мужская — Курахтин. Она образована по стандартной для русских фамилий модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Курахтина, то есть дочь или жена Курахты. В основе лежит прозвище Курахта.

Самая вероятная версия связывает Курахту с диалектным глаголом «курахтаться» — возиться, хлопотать, суетиться, делать что-то с трудом или неловко. В некоторых говорах так называли неуклюжего, медлительного или слишком хлопотливого человека. В северных и сибирских говорах слово «курахта» могло означать также «сор» или «хлам», но в качестве прозвища оно, скорее, относилось к человеку, который копается, мешкает.

Менее распространенная, но возможная гипотеза — связь с названием птицы «курахтан» (турухтан), но для фамилии Курахтин такое происхождение менее типично, так как в русской ономастике прозвища от названий птиц чаще оформляются суффиксом -ов/-ев (Курахтанов). А вариант с -ин указывает на более древнюю, личную основу.

Фамилия Курахтин встречается преимущественно в центральных и северных областях России, особенно в Архангельской, Вологодской и Кировской областях. Социально предки Курахтиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище по характеру или манере поведения.