Фамилия Курсеев образована от имени Курсей. В основе лежит арабское слово «курси» — «трон». Такое имя могли дать ребенку в семье, где ждали наследника, которому суждено занять высокое положение. Но есть и бытовая версия: родоначальник фамилии мог заниматься изготовлением тронов или торговать мебелью. Слово «курси» в тюркских языках, испытавших влияние арабского, закрепилось именно в значении «стул», «кресло», поэтому прозвище Курсей мог получить и простой столяр.

Фамилия строится по стандартной русской модели: к основе Курсей добавляется суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Курсеев). Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ или нецерковных имён, и широко распространена на юге России и в Поволжье, где сильны тюрко-арабские языковые контакты.

Однокоренные фамилии — Курсеев, Курсеевский, Курсеинов. Встречается также вариант написания Курсеевъ (с твёрдым знаком), что указывает на дореволюционное происхождение носителей, вероятно, из купеческой или мещанской среды. Географически фамилия тяготеет к Татарстану и Башкортостану, что подтверждает её восточные корни.