Фамилия Кусайкин — редкий случай, когда прозвище напрямую отсылает к поведению, а не к профессии или внешности. В её основе лежит глагол «кусать», но не в прямом, бытовом смысле. Скорее всего, прозвище Кусайка дали человеку с острым языком, язвительному, любящему «кусаться» словом. В русских говорах «кусака», «кусайка» — задира, бранчливый человек, тот, кто придирается и задевает других. Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным названием насекомого — овода или слепня, которого в некоторых областях называли «кусайкой». Тогда прозвище мог получить назойливый или надоедливый человек.

Модель образования проста и прозрачна: к основе «Кусайк-» добавили типичный русский суффикс принадлежности «-ин», указывающий на родство. Кусайкин буквально означает «сын Кусайки» или «человек из рода Кусайки». Суффикс «-ин» характерен для фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на «-а» или «-я», и широко распространён в северных и центральных областях России.

Фамилия Кусайкин редкая, её нет в массовых списках дворянских или купеческих родов. Это, скорее всего, крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали по характеру и быстро закреплялись за потомками. Интересно, что при всей своей прозрачности фамилия избежала искажений и переосмыслений — она сохранила исходную глагольную форму прозвища, что делает её наглядным примером русской антропонимии XIX века, когда личное прозвище переходило в наследственное имя без изменений.