Скорее всего, фамилия Кусаев образована от имени Кусай, которое, вероятно, происходит от чеченского слова «кIус» - «макушка головы». Согласно другой версии, это имя имеет тюркские корни и этимологически связано с киргизским словом «куса» — «тоска, печаль». В таком случае имя Кусай было своего рода «охранным», т.е. призванным уберечь ребенка от печали. Существует также гипотеза, что фамилия Кусаев является славянской. В этом случае прозвище Кусай восходит к глаголу «кусать». Обычно так называли злых животных, которые бросались на людей. Применительно к человеку прозвище Кусай, скорее всего, указывало на характер: агрессивность, злость и т.д. Таким образом, потомок человека, которого звали Кусай, со временем получил фамилию Кусаев.