Фамилия Кусаинова образована от имени Кусаин (Хусаин), связанного с происхождением и ранним периодом мусульманства. Первоначальная форма имени Кусаин — Husain (Хусейн). Хусейн был вторым сыном Али, третьим халифом шиитов. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Кусаиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.