Фамилия Кузикин — один из тех редких случаев, когда основа фамилии почти полностью совпадает с современным нарицательным словом, но её значение в родовом имени оказывается иным. В основе лежит имя Кузя. Это не самостоятельное крестильное имя, а народная, обиходная форма от целого ряда канонических имён: Кузьма, Константин, а иногда и от Косьмы. Уменьшительный суффикс -я (как Ваня, Петя, Митя) в XIX веке был чрезвычайно продуктивен, и Кузя могло быть домашним прозвищем для любого мальчика, носившего имя, начинавшееся на «Ко-» или «Ку-».

Модель образования фамилии — суффикс -ин. В русской ономастике он указывает на принадлежность: «чей сын?» — Кузикин, то есть сын Кузики. А вот суффикс -ик- внутри основы — редкая и показательная деталь. Это не просто «Кузя», а «Кузик»: так в некоторых говорах называли маленького Кузю или человека невысокого роста, щуплого телосложения. Двойной уменьшительный суффикс (-ик + -ин) встречается в фамилиях типа Васькин, Петькин, но в форме Кузикин он подчёркивает, что прозвище было именно ласкательным, почти семейным.

Географически фамилия Кузикин тяготеет к центральным и северным областям России — Владимирской, Ярославской, Костромской, а также к Поволжью. В этих регионах суффикс -ик в прозвищах был особенно распространён. В отличие от южнорусских фамилий на -енко или западнорусских на -ович, Кузикин — типичный пример северо-восточной модели, где отчество или прозвище «застывало» в форме притяжательного прилагательного.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «кузика» — так в некоторых местах называли кузнечика или мелкую мошку. Если это так, то прозвище Кузик мог получить человек суетливый, юркий или невысокий. Но эта гипотеза уступает первой: антропонимическая модель «от имени» в русских фамилиях встречается в десятки раз чаще, чем «от насекомого».

Сословная принадлежность носителей фамилии Кузикин в основном крестьянская и мещанская. В ревизских сказках XIX века Кузикины чаще всего значатся как государственные крестьяне или дворовые люди. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это фамилия людей «из простых», что, впрочем, не умаляет её самобытности.