Фамилия Кузиненко образована по той же модели, что и тысячи украинских фамилий на -енко. Если разобрать её по частям, основа «Кузин» восходит к имени Кузьма (в народной форме Кузя), а суффикс -енко в XVII–XVIII веках в Поднепровье и Слобожанщине означал «сын» или «потомок». То есть Кузиненко — буквально «сын Кузи» (уменьшительного от Кузьмы). В реестрах запорожских казаков и переписных книгах Гетманщины такие фамилии на -енко фиксировали не только родство, но и принадлежность к определённому роду: Кузиненко — потомок того, кого в семье звали Кузей.

Кузьма — имя греческого происхождения (kosmos — «мир, порядок»), но в быту его сокращали до Кузя, Кузька, Кузин. Отсюда же пошли однокоренные фамилии Кузин, Кузьменко, Кузьмин — но если Кузин (на -ин) типичен для северных русских земель, то Кузиненко — южный, украинский вариант. В XIX веке такие фамилии активно записывали в Харьковской, Полтавской, Черниговской губерниях, где суффикс -енко был главным способом образования фамилий у крестьян и казаков.

Интересная деталь: в старых метрических книгах встречаются варианты написания Кузиненко через «ы» — Кузыненко, а также с одним «н» — Кузиненко. Это не ошибка, а отражение живого произношения: в говорах Лево-бережной Украины безударный «и» звучал ближе к «ы», а двойное «н» в суффиксе не было обязательным. Так что предки современного Кузиненко могли быть записаны и как Кузиненко, и как Кузыненко — в зависимости от писаря.

Какого сословия были первые носители? Скорее всего, казацкого или крестьянского. Фамилии на -енко в массе своей принадлежали не шляхте, а свободным военным поселенцам и мещанам. Дворянские роды с таким суффиксом встречаются редко — обычно они получали фамилии на -ский или -ович. Поэтому Кузиненко — фамилия, которая говорит о происхождении из среды украинского казачества или посполитых крестьян.

Если сравнивать с другими фамилиями того же корня: Кузьменко — самая частая, Кузин — русский аналог, а Кузиненко — более редкая, но структурно прозрачная форма. Она сохранила уменьшительное «Кузя» в основе, что делает её особенно «домашней» по звучанию. В современных украинских телефонных справочниках Кузиненко встречается в основном в центральных и восточных областях — Полтавской, Днепропетровской, Кировоградской. Это подтверждает исторический ареал: фамилия не ушла далеко от мест, где её давали триста лет назад.