Фамилия Кузякова женского рода, а её мужская форма — Кузяков. В основе фамилии лежит имя Кузяк. Чаще всего это просторечная, обиходная форма крестильного имени Кузьма. Само имя Кузьма восходит к греческому «косма» — «мир, порядок, мироздание» или «украшение». В таком случае предок Кузяковых был человеком простого звания, ведь в крестьянской и мещанской среде полные имена нередко заменяли сокращёнными, вроде Кузяк.

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. Кузяк могло быть и тюркским именем — фонетическим вариантом имени Кузак, что переводится как «стручок гороха». У тюркских народов такое имя давали мальчику с пожеланием многодетности: чтобы детей у него было столько же, сколько горошин в стручке. Если эта гипотеза верна, фамилия Кузякова имеет не славянские, а восточные корни и связана с мусульманской традицией имянаречения.

Обе версии имеют право на существование, и определить, какая из них верна для конкретной семьи, можно только по географическому распространению фамилии. Если корни рода — в Поволжье, Приуралье или Сибири, где веками жили рядом русские и тюркские народы, тюркское происхождение имени Кузяк становится вполне вероятным. В центральных же областях России надёжнее считать Кузяка производным от Кузьмы.