Фамилия Кузякин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: к основе, в роли которой выступило имя или прозвище Кузяка, добавили суффикс принадлежности -ин. Суффикс указывал на то, что речь идёт о сыне, внуке или потомке Кузяки. В быту приставка «чей?» (Кузякин сын) закрепилась и превратилась в фамилию.

Имя Кузяка — это краткая, обиходная форма от канонического мужского имени Косма. В русском языке имя Косма через народную переработку превратилось в Кузьму, а уже от Кузьмы образовалось множество уменьшительно-ласкательных вариантов, в том числе и Кузяка. Таким образом, предок носителя фамилии Кузякин, скорее всего, носил имя Кузьма, а в кругу близких его называли Кузякой. Со временем эта домашняя форма стала родовым прозвищем, а затем и фамилией.

Словообразовательная цепочка здесь прозрачна: греческое имя Косма (означающее «украшение», «порядок») → русское Кузьма → разговорное Кузяка → фамилия Кузякин. Интересно, что в некоторых говорах Кузякой могли прозвать не только Кузьму, но и человека с каким-то особым качеством, например, неряшливого или, наоборот, дотошного, но основная и самая достоверная версия — от имени Кузьма.

Фамилия Кузякин не относится к числу очень частых, но встречается в разных регионах России, преимущественно в центральных и поволжских областях, что совпадает с зоной бытования имени Кузьма. По социальному составу это фамилия крестьянская или мещанская: в среде простых людей прозвищные фамилии на -ин закреплялись особенно прочно.