Фамилия Кузюков — это «отчество второго порядка», то есть она указывает на внука: Кузюков значит «сын Кузюка», а Кузюк, в свою очередь, «сын Кузи». Исходное имя Кузя — ласкательная, домашняя форма крестильного мужского имени Кузьма. Само имя Кузьма пришло на Русь из Византии и восходит к греческому Косма (Κοσμᾶς), которое связано со словом kosmos — «порядок, мироздание, украшение». В народном сознании это имя прочно ассоциировалось с ремеслом: Кузьма считался покровителем кузнецов, что породило множество пословиц и поговорок.

В основе фамилии лежит не само имя, а его уменьшительно-ласкательный вариант Кузя. В быту так могли звать не только ребёнка по имени Кузьма, но и взрослого мужчину — для простоты или по-свойски. От Кузи образовали форму Кузюк (с суффиксом -юк, характерным для южнорусских, украинских и белорусских говоров), а от неё — фамилию Кузюков по стандартной модели на -ов.

Таким образом, предок носителя этой фамилии, скорее всего, был из регионов, где были распространены уменьшительные формы на -юк (современные Украина, Белгородская, Воронежская, Курская области). Мог он быть и прямым потомком человека по имени Кузьма, которого в семье звали просто Кузей. Фамилия фиксирует не столько занятие, сколько родство: кем бы ни был первый Кузя — крестьянином, ремесленником или служилым человеком — его внук стал Кузюковым.